การให้ยา baloxavir หลังจากเริ่มติดเชื้อใหม่ ๆ เพียงขนานเดียว สามารถลดอุบัติการณ์ของไข้หวัดใหญ่ตามฤดูกาลได้
          องค์การอาหารและยาแห่งสหรัฐอเมริกา (U.S. FDA) ได้ให้ความเห็นชอบกับยา baloxavir marboxil (baloxavir) ในปี 2018 เพื่อรักษาไข้หวัดใหญ่ตามฤดูกาลสายพันธุ์ A และ B  ยานี้ออกฤทธิ์ด้วยการยับยั้งเอนไซน์ cap-dependent endonuclease ซึ่งส่งผลให้มีการรบกวนการสังเคราะห์ mRNA ของไวรัส
          การใช้ยาเพียงขนานเดียวมีประสิทธิผลในการลดระยะเวลาของอาการเจ็บป่วยเท่ากับการใช้ยากลุ่ม neuraminidase inhibitors วันละ 2 ครั้ง เป็นเวลา 5 วัน ตามคำแนะนำ  อย่างไรก็ตาม มีไวรัสที่ดื้อยา baloxavir เกิดขึ้น ซึ่งมีความไวน้อยกว่าไวรัสสายพันธุ์ดั้งเดิม (wild-type viruses) 10 ถึง 420 เท่า  variant viruse นี้ (ซึ่งปกติอยู่ในหมูแต่ต่อมาตรวจพบในมนุษย์) มีการทดแทนกรดอะมิโนใน polymerase acidic protein (PA)
          ในการศึกษาเชิงสุ่มแบบปิด 2 ทาง ควบคุมด้วยยาหลอกในหลายศูนย์ คณะผู้วิจัยในประเทศญี่ปุ่นได้ประเมินผลในเชิงป้องกันโรคของยา baloxavir ขนานเดียวเทียบกับยาหลอกในผู้สัมผัสโรคร่วมบ้าน 752 คน ซึ่งมีผู้ป่วยที่รับการยืนยันแล้ว 545 คน
          การป้องกันโรคได้เริ่มขึ้นภายใน 2 วัน หลังการสัมผัส (ร้อยละ 72.5 ภายใน 1 วัน)  มีการติดตามผู้เข้าร่วมการศึกษาเกี่ยวกับอาการไข้หวัดใหญ่ที่เกิดใหม่หรือผลการทดสอบอย่างรวดเร็วที่ให้ผลเป็นบวก (positive rapid test) เป็นเวลา 10 วัน ส่วนใหญ่เป็นผู้ป่วยกลุ่มแรกที่ตรวจพบเชื้อ (ร้อยละ 73.6) แต่มีเพียงร้อยละ 19.0 ของผู้สัมผัสที่อายุน้อยกว่า 12 ปี   จากผู้ป่วยกลุ่มแรก พบว่า ร้อยละ 95.6 เป็นไข้หวัดใหญ่สายพันธุ์ A
          พบไข้หวัดใหญ่ที่ได้รับการยืนยันจากห้องปฏิบัติการในผู้ป่วยร้อยละ 1.9 ของกลุ่ม baloxavir เทียบกับร้อยละ 13.6 ของกลุ่มยาหลอก
          สำหรับผู้รับยา baloxavir ซึ่งเป็นไข้หวัดใหญ่ การเจ็บป่วยเกิดขึ้นช้ากว่าเมื่อเทียบกับผู้ที่ได้รับยาหลอก  ผลของยา baloxavir ค่อนข้างต่ำในกลุ่มเด็กอายุต่ำกว่า 12 ปี  จากบรรดาผู้รับการป้องกันด้วยยา baloxavir จำนวน 20 คน ซึ่งมีผลตรวจไข้หวัดใหญ่เป็นบวก พบว่า มี 11 คน ที่มี variant virus ซึ่งมีการทดแทน PA   ผู้ป่วยเหล่านี้มีความไวต่อยา neuraminidase inhibitors
          การให้ยา baloxavir เพื่อป้องกันไข้หวัดใหญ่ในผู้สัมผัสโรคร่วมบ้านกับผู้ป่วยที่ได้รับการยืนยันว่าเป็นไข้หวัดใหญ่ ปรากฏว่ามีประสิทธิผลในการป้องกันไข้หวัดใหญ่  ยา baloxavir ยังลดจำนวนไวรัสในทางเดินหายใจด้วย ซึ่งอาจช่วยลดการถ่ายทอดเชื้อจาก index case แต่สำหรับการป้องกันโรคอาจจะต้องใช้ยาภายใน 2 วัน หลังการสัมผัส  การให้วัคซีนต่อต้านสายพันธุ์ไข้หวัดใหญ่ตามฤดูกาลถือว่าเป็นการป้องกันการติดเชื้อที่ดีที่สุด